Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms