Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms