Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms