Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c3Q3TMP1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms