Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms