Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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