Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpusd2Q149F1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms