Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms