Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms