Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MestQ07646 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms