Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms