Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms