Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CkbQ04447 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms