Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgfr4Q03142 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms