Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms