Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms