Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tarbp2P97473 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms