Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms