Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms