Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tubg1P83887 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms