Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SgcgP82348 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcgP82348 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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