Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms