Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux2P70298 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux2P70298 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux2P70298 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms