Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza3P70190 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza3P70190 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza3P70190 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza3P70190 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza3P70190 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza3P70190 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capza3P70190 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capza3P70190 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capza3P70190 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capza3P70190 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capza3P70190 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capza3P70190 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza3P70190 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms