Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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