Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps18P62270 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps18P62270 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms