Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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