Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms