Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace1P56818 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms