Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa6P50704 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms