Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms