Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfbP49766 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms