Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms