Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb42P49222 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms