Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LmnaP48678 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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