Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc2P43407 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc2P43407 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc2P43407 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc2P43407 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc2P43407 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdc2P43407 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdc2P43407 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdc2P43407 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdc2P43407 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sdc2P43407 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sdc2P43407 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sdc2P43407 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sdc2P43407 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sdc2P43407 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sdc2P43407 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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