Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ItgavP43406 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ItgavP43406 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms