Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms