Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms