Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptpn11P35235 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ptpn11P35235 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ptpn11P35235 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ptpn11P35235 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ptpn11P35235 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms