Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Dusp1P28563 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dusp1P28563 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms