Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hoxd10P28359 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hoxd10P28359 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hoxd10P28359 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hoxd10P28359 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Hoxd10P28359 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Hoxd10P28359 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Hoxd10P28359 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Hoxd10P28359 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Hoxd10P28359 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms