Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms