Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms