Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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