Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms