Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfyaP23708 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfyaP23708 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms