Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms