Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NefhP19246 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NefhP19246 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms