Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps6ka1P18653 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms